Que peut apporter la surveillance en temps quasi réel du vSRRP en Ontario ?
Les données diagnostiques de laboratoire ont permis un suivi rapide des tendances du vSRRP en Ontario, tout en montrant l’importance de la qualité des métadonnées et les limites du RFLP.
Les données diagnostiques de laboratoire ont permis un suivi rapide des tendances du vSRRP en Ontario, tout en montrant l’importance de la qualité des métadonnées et les limites du RFLP.
Problème : Les données diagnostiques de laboratoire sont abondantes mais leur utilisation pour une surveillance continue du vSRRP exige une agrégation, une standardisation et une interprétation épidémiologique appropriées.
Méthodes : Les auteurs ont développé des tableaux de bord actualisés quotidiennement à partir des données du laboratoire de santé animale de l’Université de Guelph, comprenant 26 535 soumissions utilisables entre 2014 et juillet 2023 et 13 299 soumissions provenant de 1 221 sites entre 2018 et juillet 2023 pour les analyses au niveau des fermes.
1. Le nombre moyen de fermes testées chaque semaine est passé de 24 en 2018 à 48 en 2023, tandis que le nombre moyen de fermes positives est passé de 5 à 11 par semaine.
2. Parmi 1 427 soumissions typables entre 2019 et juillet 2023, 80 profils RFLP ont été identifiés et les profils 1-8-4, 1-1-1, 1-4-2 et 2-5-2 représentaient ensemble 59,5 % des résultats.
3. Les auteurs montrent que les données diagnostiques peuvent soutenir une surveillance temporelle rapide, tout en soulignant que les tendances observées dépendent de la qualité des métadonnées, des pratiques de soumission et des limites du RFLP comme outil de classification moléculaire.
Publication originale
Petukhova T et al. Insights gained through real-time monitoring of porcine reproductive and respiratory syndrome virus and description of temporal trends based on laboratory data in Ontario, Canada. Frontiers in Veterinary Science. 2025;12:1528422.